כמות חלבון במדגם של השריר דגים זה ניתן להביא אל פתרון בתנאים שצוינו של הממס ונהלים. זה משמש בעיקר אינדקס של נזק דגים שרירים מבנה חלבונים על-ידי אחסון קפוא. שלה ירידות ערך עם אחסון קפואים במחירים תלויים טמפרטורת אחסון; התחתונה הטמפרטורה, קצב איטי יותר. כ 20-25% מן החלבונים בשריר דגים יכול להיות solubilised על ידי מיצוי פשוטה של שריר דג טחון עם מים. Proteolysis שבירת למטה של חלבונים כדי חומצות אמינו שלהם consitituent על ידי אנזימים. חלבונים יכול להיות שבור למטה חומצות אמינו על ידי הפעולה של חומצות, בסיסים (אלקלים), אך תהליך זה עדיף לייב הידרוליזה. איברים בבטן של דגים, לדוגמה, caeca מולדת, במעים הפרוטאוליטי אנזימים, (פרוטאזות), אשר לסייע בעיכול המזון, ומכילה שריר פרוטאזות שנקרא cathepsins.